Kırkağaç Lisesi lise binası olarak eski, Anadolu Öğretmen Lisesinin eğitim ve öğretimini sürdürdüğü Z planındaki binanın zamanın Belediye Başkanı Zühtü EKEN tarafından 1949-1950 Öğretim Yılında yaptırılmasıyla eğitim öğretime başlamıştır. Binanın konferans salonu 1956 yılında diğer kısımlar ise 1965 yılında tamamlanmıştır. Bu zamana kadar ortaokul olarak faaliyetini sürdürmüştür.

1973-1974 öğretim yılında ilk lise 6 derslikle eğitim öğretime başlamıştır. Lisenin ilk derslikleri o zaman Edip Bayat Ortaokulu olarak kullanılan yan binada açılmıştır. 1991-1992 Öğretim yılına kadar ortaokul ile beraber aynı bünyede eğitim öğretimi sürdürmüştür. 1992-1993 öğretim yılında ortaokul öğrencileri yeni kurulan Atatürk Edip Bayat İlköğretim Okuluna taşınınca müstakil lise olarak kalmıştır.

1995-1996 öğretim yılında okulumuz bünyesinde yabancı dil ağırlıklı lise açılmıştır. Derslik sayısı her geçen yıl ihtiyaca cevap veremeyecek bir hale gelmiştir.

Kırkağaç Ecz.Engin Ümmetoğlu Lisesi 12.05.2004 tarihinde Eğitime %100 Destek Kampanyası çerçevesinde Kırkağaç'lı Hayırsever Ecz.Engin Ümmetoğlu'nun katkısıyla 18 derslikli okul yapımına başlamış 26.02.2005 tarihinde tamamlanmış olup, resmi olarak eğitim ve öğretime açılmıştır. Okul bünyesinde 1990'ların sonundan 2006'ya kadar lise programının yanında Yabancı Dil Ağırlıklı Lise, 2010 yılı yazından bu yana da Lise ve Anadolu Lisesi programları bulunmaktadır. Okulumuz 2010 yazında Anadolu Lisesine dönüştürülmüş olup o tarihten sonra genel lise programına öğrenci kaydı yapılmamaktadır. Okulumuzun adı 2010 yılındaki dönüştürmeden itibaren Eczacı Engin Ümmetoğlu Anadolu Lisesi olmuştur. Okulumuz bakanlığımızın aldığı kararla Eylül 2022 den itibaren Proje Anadolu Lisesi olarak faaliyet göstermektedir.

2007 yılından bu yana okulumuza bağlı 77 kapasiteli parasız yatılı kız öğrenci pansiyonu bulunmaktadır. Pansiyonda ilimizin ve yurdumuzun birçok yerinden öğrencilerimiz barınmaktadır.